В научной медицине барбарис сибирский в силу его малой изученности применения не находит, однако алкалоид берберин относится к весьма ценным лекарственным средствам и применяется в виде бисульфата берберина в качестве желчегонного средства при хроническом гепатите, гепатохолецистите, холецистите и желчнокаменной болезни.
В народной медицине корень барбариса применяется в виде водного отвара или настойки на водке при заболеваниях печени, простудных заболеваниях как потогонное и от кашля, при желудочных заболеваниях, как маточное средство при кровотечениях, как гипотензивное средство, снижающее кровяное давление при гипертонии, как противоопухолевое, иногда при туберкулезе легких и в других случаях.
В тибетской медицине кору корней, разваренную до получения густой желтой жидкости, закапывают в глаза или раны как ранозаживляющее.
Растет барбарис на скалах, каменистых россыпях в альпийском и субальпийском поясах Западного и Восточного Саяна.
